I – NÍVEL DE DIREÇÃO SUPERIOR
1 – Gabinete do Secretário Executivo - GBEX
II – NÍVEL DE APOIO ESTRATÉGICO E ESPECIALIZADO
1 – Unidade Setorial de Controle Interno-UNISECI
III – NÍVEL DE ADMINISTRAÇÃO SISTÊMICA
1 – Superintendência de Planejamento e Finanças -SUPOF
1.1 – Coordenadoria de Planejamento- COPLAN
1.1.1 – Gerência de Acompanhamento e Avaliação- GAAV
1.1.2 – Gerência de Desenvolvimento Organizacion   GDO    - 
1.2 – Coordenadoria de Orçamento e Convênios -COC
1.2.1 – Gerência de Execução Orçamentária -GEO
1.2.2 – Gerência de Elaboração e Acompanhamento de Convênios-GEAC
1.2.3 – Gerência de Prestação de Contas de Convênio-GPCC
1.3 – Coordenadoria Financeira- CFIN
1.3.1 – Gerência de Programação Financeira-GPF
1.3.2 – Gerência de Execução Financeira-GEF
1.4 – Coordenadoria Contábil -CCON
1.4.1 – Gerência de Prestação de Contas -GPC
1.4.2 – Gerência de Conformidade-GCONF


2 – Coordenadoria de Tecnologia da Informação-CTI
2.1 – Gerência de Infra-Estrutura de Tecnologia da Informação-GEIETI
2.2 – Gerência de Desenvolvimento e Manutenção de Sistemas de Informação-GDMS
2.3 – Gerência de Assistência Técnica e Suporte a Usuários de Tecnologia da Informação- GEATSUT
2.4 – Gerência de Sistemas de Informação de Saúde- GESISA
3 – Superintendência de Gestão de Pessoas -SGP
3.1 – Coordenadoria de Provimento, Manutenção e Monitoramento -CPMM
3.1.1 – Gerência de Provimento, Seleção e Lotação-GPSL
3.1.2 – Gerência de Movimentação, Controle e Informação de Vida Funcional-
            GMCIVF
3.1.3 – Gerência de Despesa de Pessoal-GDP
3.2 – Coordenadoria de Aplicação e Desenvolvimento -CAD
3.2.1 – Gerência de Aplicação -GAPL
3.2.2 – Gerência de Desenvolvimento e Qualidade de Vida- GDQV
4 – Superintendência Administrativa-SUG
4.1 – Coordenadoria de Apoio Logístico-CAL
4.1.1 – Gerência de Patrimônio-GEPATR
4.1.2 – Gerência de Almoxarifado-GEALMO
4.1.3 – Gerência de Serviços Gerais-GESEGE
4.1.4 – Gerência de Transporte-GETRAN
4.2 – Coordenadoria de Aquisições e Contratos-CAC
4.2.1 – Gerência de Aquisições-GEAQ
4.2.2 – Gerência de Contratos-GEC
4.3 – Coordenadoria de Obras e Reformas-COOBRE
4.3.1 – Gerência de Projetos-GEPRO
4.3.2 - Gerência de Fiscalização-GEFIS
4.4 – Gerência de Protocolo-GEPROT